Charles Auguste Vagnat est né à Briançon (Hautes-Alpes) le 4 novembre 1851. Il est le fils de François Vagnat, un instituteur (né vers 1817), et de Marie-Françoise Blanchard (née vers 1828). Études de médecine et carrière de médecin Il suit des études classiques au collège de la ville puis il entre au lycée de Grenoble (Isère).